ロジックの特徴

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ロジックの特徴といえば、もちろん酵素ですが、


酵素は作用する物質を自ら選択する能力を持ち、その特性を基質特異性といいます。
(もうひとつ反応特異性もあるが、それは次回ね)


たとえば、酵素を作用させてタンパク質を分解する場合は、特定の場所のペプチドを加水分解したり、

場合によっては基質として認識しないで作用できな場合もあります。

一方、タンパク質を(酵素ではない)酸触媒で加水分解する場合は、ペプチド結合の任意の箇所に作用するので、
いろいろな長さのアミノ酸配列のペプチドやアミノ酸が作られる。また、ペプチド分解酵素はペプチド結合だけに
反応して他の結合(エステル結合やグリコシド結合)には作用しないが、酸触媒であればペプチド結合も他の結合も
区別することなく同じように分解できるわけ。

この特性は酵素の研究のごく初期から認識されており、鍵と鍵穴に例えたモデルで説明されている。

それを Lock & Key模型という。

加水分解される基質が酵素に取り込まれる時、丁度具合よくピッタリ収まるような構造類似性があるということ。
酵素の活性中心が基質分子の形状の細部にわたって、きっちりと合わせて作られているという考え方です。
これらは20世紀中頃以降、X線結晶解析で酵素分子の立体構造が特定できるようになっている。
反応の特異性というのは、触媒する化学反応の種類で実は決められています。

酵素分類番号 と反応の種類は、
1 酸化還元酵素  酸素添加または水素原子の添加、除去
2 転移酵素    原子や原子団の転移を触媒する
3 加水分解酵素  エステル、ペプチド、グリコシド結合の加水分解
4 脱離酵素    C=CC=OC=Nなどの形成
5 異性化酵素    糖、アミノ酸などの異性化を促進
6 合成酵素    ピロリン酸結合分解にともなう反応
などです。

すなわち、酵素であるタンパク質の立体構造には様々な大きさや形状の窪みが存在し、
それはタンパク質の一次配列に応じて決定付けられている。

前述の鍵穴はまさにタンパク質立体構造のくぼみであるといえる。

酵素は、くぼみに合った基質だけをくぼみの奥に存在する酵素の活性中心へ導くことで、
酵素作用を作用させるわけだ。

つづきますよ。






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